Akreditasi merupakan proses standarisasi yang dilakukan oleh penentu kebijakan pendidikan tinggi untuk menetapkan standar dan kualitas suatu perguruan tinggi. Jurusan Farmasi FKIK UIN Alauddin Makassar saat ini telah terakreditasi B sejak 2014 yang lalu. Lama berlaku akreditasi adalah 4 tahun. Itu berarti, masa akreditasi B tersebut akan berakhir pada tahun 2020. Menyikapi hal tersebut, saat ini kembali Jurusan Farmasi membentuk tim akreditasi yang diketuai oleh Alifia Putri Febrianti. Dengan dimulainya proses penyusunan dokumen akreditasi ini, diharapkan kedepannya Jurusan Farmasi FKIK UIN Alauddin Makassar dapat meraih akreditasi A.